用微波炉加热食品，不会比其他烹调方式导致更多的营养流失，因为食品营养是否流失，取决于烹调烹饪过程是否合理、操作是否科学，与使用微波炉还是其他烹调方式没有关系。可以说，任何烹调方式都会导致一定程度的营养流失，而使用微波炉并不会比别的方式流失更快、更严重。

国外的一项试验中，烹调了4种蔬菜，包括嫩芸豆、茄子、苤蓝、萝卜。分别用传统烹调方法、压力烹调、微波烹调来处理，结果发现，无论哪一种烹调方法，其中蛋白质、脂肪、总灰分、钙、磷、铁和膳食纤维的含量变化都很小。真正变化大的是维生素C，它在高压烹调中损失最大，其次是微波烹调和传统烹调。

微波烹调也不是十全十美。据学者研究发现，部分鱼类、肉类在微波烹调后omega-3脂肪酸的比例降低较多。在鱼类烹调方法当中，清蒸和压力锅烹调保存营养较好。微波烹调更适合那些不饱和脂肪酸含量不太高的食物。